Elena Magarotto consegue la laurea a pieni voti in architettura il 30 marzo 2004 presso il Politecnico di Milano con una tesi dal titolo "Bolle sostenibili. Tecnologie per il risparmio energetico in un progetto di edilizia residenziale a Como".
Nel 2008 consegue con merito il titolo di Dottore di Ricerca in Design e Tecnologie per la Valorizzazione dei Beni Culturali" con una tesi dal titolo “Tecnologie innovative di rivestimento negli interventi sul costruito storico. Il contributo della produzione industriale”. Da ottobre 2008 è assegnista di ricerca presso il Laboratorio di Informazione Tecnica del Dipartimento BEST – Politecnico di Milano, svolgendo una ricerca dal titolo “Ricerca di sistemi costruttivi tradizionali e innovativi per la realizzazione di un database per il Laboratorio di Informazione Tecnica del Dipartimento B.E.S.T.”.
Nell’attività di ricerca presso il Politecnico di Milano si occupa in particolare di tecnologie e sistemi innovativi per l’involucro, valorizzazione di beni culturali alla scala dell’edificio, sistemi e tecnologie in acciaio.
Collabora con il Gruppo Iris Ceramica Group dal 2005, dove svolge attività di coordinamento di grandi progetti e cantieri, valutazioni tecniche e studi di fattibilità.
Dal 2019 è responsabile per Iris Ceramica Group dello sviluppo tecnico di prodotti e sistemi e della struttura Granitech, che si occupa della progettazione e realizzazione di involucri architettonici.